Władimir Manczew zawodową karierę rozpoczynał w 1996 roku w Spartaku Plewen grającym w rozgrywkach drugiej ligi bułgarskiej. Następnie przeniósł się do klubu FC Yantra, a latem 1998 roku został zawodnikiem Chebara Pazardżik. Dla nowego klubu w 21 meczach drugiej ligi strzelił piętnaście bramek i dzięki dobrej skuteczności po zakończeniu rozgrywek trafił do CSKA Sofia. W 1999 roku wywalczył z nim Puchar Bułgarii, a w 2000 i 2001 roku sięgnął po tytuł wicemistrza kraju. W trakcie pierwszych dwóch sezonów spędzonych w nowej drużynie Manczew zdobył tylko pięć goli, jednak później imponował skutecznością. Podczas rozgrywek 2000/2001 zanotował szesnaście trafień w 24 pojedynkach, natomiast w sezonie 2001/2002 dzięki strzeleniu 21 bramek w 33 spotkaniach zapewnił sobie koronę króla strzelców. W letnim okienku transferowym Bułgar postanowił zmienić zespół i ostatecznie przeszedł do francuskiego Lille OSC. Tam miał zapewnione miejsce w podstawowej jedenastce i w linii ataku grał zazwyczaj razem z Chilijczykiem Héctorem Tapią. Z Lille Manczew zajął kolejno czternaste i dziesiąte miejsce w rozgrywkach Ligue 1, a w sezonie 2003/2004 z trzynastoma golami na koncie znalazł się na dziewiątym miejscu w klasyfikacji najlepszych strzelców. W 2004 roku bułgarski gracz podpisał kontrakt z beniaminkiem Primera División - Levante UD, jednak zajął z nim osiemnaste miejsce w ligowej tabeli i spadł do drugiej ligi. Sezon 2006/2007 Manczew spędził na wypożyczeniu w Realu Valladolid, w rundzie jesiennej rozgrywek 2007/2008 grał w Celcie Vigo, natomiast w rundzie wiosennej ponownie został piłkarzem Realu Valladolid. Latem 2008 roku Manczew powrócił do mistrza Bułgarii - CSKA Sofia.