Keita pochodzi z Bamako, stolicy Mali. Piłkarską karierę rozpoczął w tamtejszym klubie Centre Salif Keita, a w wieku 17 lat, czyli w 1997 roku wyemigrował do Francji i został zawodnikiem Olympique Marsylia. Przez pierwsze dwa sezony występował w rezerwach klubu, a w sezonie 1999/2000 w końcu został włączony do kadry pierwszego zespołu. 1 września 1999 zadebiutował w Ligue 1 meczem z Troyes AC (1:0), ale nie zdołał przebić się do składu OM i rozegrał dla niej tylko 6 spotkań. Latem 2000 Keita przeszedł do FC Lorient, w którym grał w pierwszym składzie i wywalczył awans z Ligue 2 do Ligue 1. W Lorient przez rok występował w pierwszej lidze, zdobył z nim Puchar Francji, ale spadł z ligi.

Po spadku Lorient, latem 2002 Keita przeszedł do RC Lens. Swój pierwszy mecz w barwach Racingu rozegrał 3 sierpnia, a jego klub zremisował 1:1 na wyjeździe z Bastią. W Lens szybko wywalczył miejsce w podstawowym składzie, a 10 sierpnia 2002 zdobył swojego pierwszego gola na boiskach Ligue 1 (Lens – FC Sochaux-Montbéliard 1:1). W tym samym sezonie zadebiutował w rozgrywkach Ligi Mistrzów, a następnie w Puchare UEFA. Przez 2 kolejne lata zajmował z Lens 8. pozycję w lidze, a w 2005 roku zakończył sezon na 7. miejscu. W 2006 roku dzięki 4. miejscu zakwalifikował się do Pucharu UEFA z Lens, a w 2007 roku zajął 5. lokatę i z Lens wystąpi w Pucharze Intertoto. W tym ostatnim sezonie błysnął wysoką skutecznością jak na defensywnego pomocnika i zdobył aż 11 bramek w lidze, co jest jego najlepszym dotychczas dorobkiem w karierze. Latem 2007 Keita za 5 milionów euro przeszedł do trzeciej drużyny Primera División, Sevilla FC.

Po jednym sezonie gry dla Sevilli podpisał 4-letni kontrakt z FC Barceloną z klauzulą odejścia wynoszącą 90 milionów euro