Santi Cazorla jako junior trenował w Realu Oviedo oraz Villarreal CF. W 2003 roku został włączony do dorosłej kadry "Żółtej Łodzi Podwodnej". Swój debiut w Primera División zaliczył 30 października w wygranym 1:0 meczu z Deportivo La Coruña, kiedy to w 89 minucie spotkania zmienił Rogera Garcię. W debiutanckim sezonie w barwach Villarrealu Cazorla wystąpił tylko w dwóch ligowych pojedynkach, jednak w kolejnych rozgrywkach rozegrał już 28 meczów. Zanotował wówczas także cztery bramki w Pucharze UEFA, a hiszpański klub w ćwierćfinale został wyeliminowani przez AZ Alkmaar. W sezonie 2005/06 Cazorla zadebiutował w rozgrywkach Ligi Mistrzów, a jego klub został wyeliminowany dopiero w półfinale. 7 lipca 2006 roku Hiszpan za 600 tysięcy euro odszedł do Recreativo Huelva, z którym podpisał czteroletni kontrakt. Postawa Cazorli w nowej drużynie spowodowała, że został wybrany najlepszym zawodnikiem Primera División według magazynu "Don Balón"[1]. Na początku 2007 roku zmarł ojciec hiszpańskiego zawodnika, a Santi zadedykował mu bramkę strzeloną w wygranym 4:2 pojedynku z Racingiem Santander. Latem 2007 roku Villarreal CF skorzystał z klauzuli zawartej w umowie z Recreativo i odkupił Cazorlę za 1,2 miliona euro. Hiszpański zawodnik stworzył linię pomocy razem z Marcosem Senną, Robertem Pirèsem oraz Matíasem Fernándezem. 26 sierpnia 2008 roku Cazorla ogłosił, że jego pozyskaniem zainteresowany jest Real Madryt[2], jednak Hiszpan ostatecznie zdecydował się pozostać w ekipie "Żółtej Łodzi Podwodne