Owomoyela urodził się w Hamburgu. Jego ojciec jest Nigeryjczykiem, a matka Niemką. Do piłkarskiego klubu trafił już w wieku 4 lat, a był to Grün-Weiß Eimsbüttel. Do 1998 roku grał w innym mniejszym amatorskim klubie, TSV Stellingen 88. Wtedy to przeszedł do Lüneburger SK, w którym w sezonie 2000/2001 wystąpił w Regionallidze, jednak drużyna opuściła ligę zajmując 17. miejsce. W sezonie 2001/2002 Owomoyela zakładał koszulkę VfL Osnabrück (7. miejsce). Sezon 2002/2003 to gra w SC Paderborn 07, z którym Patrick zajął 8. miejsce.

Dobra gra w Regionallidze spowodowała, że latem 2003 trener Arminii Bielefeld, Benno Möhlmann, sprowadził Owomoyelę do swojego klubu. W 2. Bundeslidze Owomoyela zagrał w 33 meczach i zdobył 3 gole, a z Arminią zajął 2. miejsce, premiowane awansem do pierwszej ligi. W Bundeslidze Owomoyela zadebiutował 8 sierpnia 2004 w zremisowanym 0:0 meczu z Borussią Mönchengladbach. Natomiast w 6. kolejce ligowej zdobył swojego pierwszego gola, a Arminia pokonała na wyjeździe 1. FC Nürnberg 2:1. Owomoyela był podporą prawej flanki Arminii i jednym z jej najlepszych zawodników w sezonie. Rozegrał 30 meczów i strzelił 5 goli.

Latem 2005 Patrickem interesowały się czołowe kluby Bundesligi, jednak czarnoskóry zawodnik wybrał ofertę Werderu Brema, do którego przeszedł za 2 miliony euro. W Werderze zadebiutował w 1. kolejce, 5 sierpnia w wygranym 5:2 meczu z Arminią Bielefeld. Od 2. kolejki był już podstawowym zawodnikiem Werderu i wystąpił w 32 meczach Bundesligi zdobywając wicemistrzostwo Niemiec. Z Werderem zagrał także w Lidze Mistrzów i doszedł z nim do 1/8 finału. W fazie tej niemiecki klub przegrał w dwumeczu z Juventusem Turyn dzięki gorszemu bilansowi bramek zdobytych na wyjeździe. Na początku sezonu 2006/2007 Owomoyela wystąpił w wygranym 2:0 finale Pucharu Ligi Niemieckiej z Bayernem Monachium. W lidze grał jednak mało, gdyż niemal od początku sezonu leczył kontuzję, której doznał we wrześniu, a odnowiła mu się ona w grudniu. Zarówno w sezonie 2006/2007 jak i 2007/2008 wystąpił zaledwie w 9 spotkaniach i miał niewielki udział w zajęciu przez Werder odpowiednio drugiego i trzeciego miejsca w lidze.

W lipcu 2008 roku Owomoyela odszedł do Borussii Dortmund. Klub z Dortmundu zapłacił za niego kwotę 2,5 miliona euro. Patrick podpisał kontrakt do 2011 roku.

źródło: wikipedia.pl