Miguel Ángel Ferrer Martínez zawodową karierę rozpoczynał w 1996 roku w Realu Madryt. Początkowo występował w trzecim zespole "Królewskich", a w 1997 roku znalazł się w kadrze Realu Madryt Castilla, czyli drużyny rezerw hiszpańskiego klubu. Grywał tam regularnie, a w sezonie 1997/98 w 27 spotkaniach zdobył dziewiętnaście bramek. W styczniu 1999 roku Mista został wypożyczony do CD Tenerife, a następnie działacze "Chicharreros" wykupili hiszpańskiego napastnika na stałe. W nowej drużynie Miguel wywalczył sobie miejsce w pierwszej jedenastce i był jedną z najważniejszych postaci w zespole. Łącznie dla CD Tenerife wychowanek Realu Madryt rozegrał 84 ligowe pojedynki, w których 22 razy wpisał się na listę strzelców. W sezonie 2000/01 wywalczył awans z Segunda División do Primera División. Latem 2001 roku Mista podpisał kontrakt z Valencią CF. W 2002 i 2004 roku sięgnął z nią po mistrzostwo kraju, a w 2004 roku triumfował także w rozgrywkach Pucharu UEFA oraz Superpucharu Europy. W letnim okienku transferowym w 2006 roku Hiszpan przeniósł się do Atlético Madryt. W lipcu 2008 roku został zawodnikiem Deportivo La Coruña, w barwach którego zadebiutował 31 sierpnia w wygranym 2:1 meczu z Realem Madryt.