W wieku 5 lat Leo zaczął treningi w argentyńskiej drużynie Gandol (prowadzonej przez jego ojca). Messi robił szybkie postępy i w 1995 roku przeniósł się do Newell's Old Boys. Młodym piłkarzem szybko zainteresował się jeden z największych klubów w Argentynie – Club Atlético River Plate. Jednak badania medyczne zawodnika wykazały, że w jego organizmie brakuje pewnych hormonów co uniemożliwia prawidłowy rozwój zawodnika. Jedynym ratunkiem była droga kuracja hormonem wzrostu, na którą rodzice Messiego nie mieli pieniędzy, a River Plate ostatecznie odrzucił młodego zawodnika i nie chciał mu pomóc. Wtedy na pomoc przyszła mu FC Barcelona.

Messiego do Barcelony sprowadził dyrektor techniczny tego klubu Carles Rexach. Na testach w nowym klubie Messi potwierdził, że posiada nieprzeciętne umiejętności piłkarskie (w pierwszym meczu w katalońskim klubie strzelił 5 goli) i Barcelona od razu rozpoczęła leczenie zawodnika. Po powrocie do zdrowia Messi odwdzięczył się swojemu klubowi, strzelając w pierwszym sezonie w drużynie młodzików 37 goli.

Messi zadebiutował w pierwszym składzie Barcy w sezonie 2003/2004 w meczu z FC Porto na otwarcie ich nowego stadionu. W następnym sezonie został włączony do pierwszej drużyny Blaugrany i zaczął coraz częściej pojawiać się na boiskach Primera Division. Jego debiut miał miejsce 8 października 2004 roku w meczu derbowym z Espanyol Barcelona (1:0 dla Barcelony). W 82 minucie meczu zmienił on Deco i zaprezentował się z bardzo dobrej strony, przeprowadzając kilka śmiałych rajdów i popisując się niekonwencjonalnymi podaniami. 1 maja 2005 roku w meczu z Albacete Lionel strzelił swojego pierwszego gola. W 90 minucie pokonał bramkarza przeciwników lobem. Stał się w ten sposób najmłodszym graczem w historii Blaugrany, który strzelił gola w meczu ligowym.

W czasie jego pobytu w Barcelonie wykryto u niego brak hormonów wzrostu i zaczęto terapie , cały koszt leczenia zapłaciła Barcelona.

W następnym sezonie Lionel był już podstawowym zawodnikiem Barcy. Razem z Ronaldinho i Eto’o stworzyli oni słynny trójkąt Barcy. 7 marca 2006 roku w meczu 1/8 finału Ligi Mistrzów z Chelsea na Camp Nou Messi doznał poważnej kontuzji – zerwał jeden z mięśni w prawej nodze. Pomimo początkowych prognoz, że młody zawodnik nie zagra jedynie przez miesiąc kontuzja okazała się poważna i zawodnik nie zagrał do końca sezonu.
Messi na chwilę przed zdobyciem gola z Getafe
Messi na chwilę przed zdobyciem gola z Getafe

Od początku sezonu 2006/07 Messi był ważną postacią w Barcelonie. Strzelił kilka ważnych bramek, m.in.: w 89 minucie meczu Ligi Mistrzów z Werderem Brema, która jak się potem okazało uratowała Katalończykom awans do 1/8 finału LM. Sezon przerwała kontuzja – 13 listopada po jednym ze spotkań ligowych Lionel doznał złamania kości śródstopia i pauzował przez 3 miesiące. Po powrocie Messi osiągnął jeszcze lepszą formę. Strzelił trzy gole w meczu z Realem Madryt na Camp Nou i regularnie trafiał do bramki w innych spotkaniach ligowych. Do historii przejdzie jednak jego trafienie z Getafe w półfinale Copa Del Rey, kiedy Argentyńczyk ograł 6 przeciwników i strzelił gola. Była to bramka bardzo podobna do trafienia Diego Maradony z Mundialu w Meksyku w 1986 roku. 9 czerwca w meczu z RCD Espanyol Lionel po raz kolejny skopiował wyczyn swojego idola. Zdobył on gola ręką, co wzbudziło duże kontrowersje. Wiele gazet domagało się o ukaranie młodzieńca, jednak na Messiego nie została nałożona żadna kara. Obecnie Messi po odejściu Ronaldinho otrzymał numer "10" co jest wielkim prestiżem dla młodego Argentyńczyka. Poprzednio grał z numerami 30 i 19. Messi w sezonie 2007/2008 był trapiony przez kontuzje, jedną z nich doznał w meczu z Celticiem Glasgow w 1/8 finału LM.

źródło: wikipedia