Julio Baptista urodził się 1 października 1981 roku w São Paulo. Rozpoczął swoją profesjonalną karierę w 2000 roku w zespole São Paulo następnie przeniósł się do Sevilli i grał tam od 2003 do 2005 roku. Określony został mianem „Bestii z Sewilli”. Jest graczem bardzo uniwersalnym, mogącym grać zarówno na pozycji defensywnego pomocnika, jak również pomocnika ofensywnego, a nawet napastnika. W sezonie 2004/2004 strzelił dla Sevilli 38 goli w 63 meczach. Po zakończeniu sezonu otrzymał wiele ofert między innymi z Arsenal Londyn i Tottenham Hotspur, ale wybrał ofertę Realu. Stracił wtedy wiele w oczach kibiców z Wysp, a szczególnie fanów Kanonierów, ponieważ wcześniej długo "flirtował" z Arsenalem. Suma transferu wyniosła 20 mln €. 29 lipca 2005 roku podpisał kontrakt, który związał go z klubem na 5 sezonów. Dołączył do innych Brazylijczyków w składzie Królewskich: Ronaldo, Roberto Carlosa i Robinho. 30 sierpnia 2006 roku - w dniu zamknięcia letniego okna transferowego, przeszedł z Realu do drużyny Kanonierów na zasadzie wypożyczenia. W zamian na tej samej zasadzie do drużyny Królewskich przeszedł José Antonio Reyes, grający uprzednio w Arsenalu. Nie mamy w tym przypadku do czynienia z transferami definitywnymi z powodu umowy przedwstępnej, którą Reyes prawdopodobnie podpisał z Atletico i w przypadku transferu definitywnego musiałby zapłacić odszkodowanie klubowi z Madrytu.

Po sezonie 2006/2007 Arsenal nie zdecydował się na transfer definitywny i Baptista wrócił do Madrytu. W tym roku otrzymał hiszpański paszport. 11 sierpnia tego samego roku trafił w ramach transferu definitywnego do włoskiego klubu AS Roma za 9 mln €, z opcją dopłaty jeszcze dwóch milionów euro, jeśli zespół z Rzymu zakwalifikuje się w przyszłym sezonie do rozgrywek Ligi Mistrzów.