FK Spartak Nalczyk został założony w 1959 i grał na początku w regionalnej B-klasie. W 1965 klub wygrał te rozgrywki i awansował do A-klasy, do grupy drugiej. Spartak występował tam w latach 1966 - 1970.

Po reorganizacji ligowego futbolu w ZSRR Spartak grał w Sowieckiej Drugiej Lidze (lata: 1971, 1977 - 1978, 1981 - 1989) oraz w Sowieckiej Pierwszej Lidze (1972 - 1976, 1979 - 1980), spadając i awansując kilka razy. W latach 1990 i 1991 występował w Lidze Buforowej. Najlepszym rezultatem klubu było 14. miejsce w Pierwszej Lidze (2. poziom) w 1974 i 1975 roku.

Klub z Nalczyka zdobył również dwa razy mistrzostwo Rosyjskiej FSRR, w 1965 i 1970 roku.

W 1992 roku Spartak Nalczyk został wyznaczony do gry w Rosyjskiej Pierwszej Dywizji (2. liga), z której jednak spadł w 1993 i powrócił do niej w 1995, po dwóch sezonach spędzonych w Drugiej Dywizji. Od 1996 do 2005 klub regularnie występował w 2. lidze, w której zajął najwyższe (drugie) miejsce w 2005, co dało mu awans do Premier Ligi.

Spartak nosił w historii również nazwy: "Automobilist" (1969 - 1972) oraz "Elbrus" (1976).

Skład

Bramkarze:

Obrońcy:

Pomocnicy:

Napastnicy: