W 1920 roku został założony klub o nazwie F.C. Germinal Ekeren w mieście Ekeren, położonym na przedmieściach Antwerpii, w której to dopiero co zakończyły się Letnie Igrzyska Olimpijskie 1920. Jednak dopiero 30 lipca 1942 roku klub zarejestrowano w Belgijskim Związku Piłki Nożnej. W 1971 roku do nazwy klubu dodano człon Koninklijk, co w języku holenderskim znaczy Królewski. W 1989 roku zespół po raz pierwszy w historii awansował do pierwszej ligi Belgii i w sezonie 1989/1990 zajął w niej 13. miejsce. Najlepsze miejsce klubu w historii występów w pierwszej lidze to trzecie, które Germinal osiągnął w latach 1996 oraz 1998, co dało temu klubowi prawo startów w Pucharze UEFA. Jednak w 1999 z powodu niskiego zainteresowania widzów, a także małych możliwości rozwoju miasta Ekeren, postanowiono dokonać fuzji z klubem Beerschot, który grał wówczas w 3. lidze belgijskiej i przechodził kłopoty finansowe.

Powstała więc nowa drużyna o nazwie K.F.C. Germinal Beerschot Antwerpia z siedzibą w Antwerpii i dzięki temu mogła grać nadal w Jupiler League. Postanowiono także rozbudować stadion dawnego Beerschotu. W roku 2004 klub zaczął ponownie mieć kłopoty finansowe. Zatrudniono wówczas trenera Marca Brysa, który w sezonie 2004/2005 zdołał zdobyć Puchar Belgii. Jednak po siedmiu kolejkach ligi został zwolniony z klubu ze względu na słabe wyniki zespołu. Nowy wówczas trener Jos Daerden zdołał utrzymać zespół w lidze, ale po sezonie ponownie zatrudniono Brysa.

Skład

Bramkarze:

Obrońcy:

Pomocnicy:

Napastnicy: